practica de busqueda de secuencias de homo sapiens

高画質はこちら　http://togotv.dbcls.jp/20080514.html DNAデータベース総覧と検索は、文部科学省統合データベースプロジェクトにおいて開発、維持されている、巨大な国際DNAバンク(INSD(International Nucleotide Sequence Database)と呼ばれるDDBJ/EMBL/GenBankのことです)を高速に検索し生物種、分子種、プロジェクトに分類して表示するシステムです。 ある研究機関から発表されたある生物のゲノムデータを一括してダウンロードするというような研究単位でのデータ取得ができます。BLASTによる配列検索、核酸関連の特許公報へのダイレクトリンク、レコードの時系列展開も可能です。 今回はその使い方の概要を特許として登録されているDNA配列の閲覧を例にその使い倒し方を紹介しています。

Tutorial Entrez: parte 1

Tutorial Entrez: parte 2

This is one of the lectures from the first course on computational biology given by the National Center for Biotechnology Information.

Tutorial Entrez: parte 3

This is an excerpt from Jim's lecture in a one-semester course in computational biology given at the National Center for Biotechnology Information in the Fall of 1990.

高画質版はこちら http://togotv.dbcls.jp/movie/080926refseq_f.html RefSeqとは、Reference Sequenceの略で、NCBIが提供する配列解析に使うための文字通り"reference"となるべき配列データベースのことです。その配列の多くはDDBJやEMBL、GenBank由来であり、それらの中からもっとも代表としてふさわしい（参照の基準となる）ものが、目で見て選ばれています。 今回の番組では、このRefSeqデータベースから自分の興味ある遺伝子のRefSeq IDを調べ、そのmRNA配列とアミノ酸配列を取得する方法について説明しています。

homosapiens en genbank y embl

Excerpt from a lecture on sequence database searching by NCBI Director David Lipman.